ท้องที่อำเภอหนองเรือประกอบด้วยองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น 13 แห่ง ได้แก่

• เทศบาลตำบลหนองเรือ ครอบคลุมพื้นที่บางส่วนของตำบลหนองเรือ

• เทศบาลตำบลดอนโมง ครอบคลุมพื้นที่บางส่วนของตำบลบ้านกงและตำบลจระเข้

• เทศบาลตำบลหนองแก ครอบคลุมพื้นที่บางส่วนของตำบลกุดกว้างและตำบลโนนสะอาด

• เทศบาลตำบลโนนทอง ครอบคลุมพื้นที่ตำบลโนนทองทั้งตำบล

• เทศบาลตำบลกุดกว้าง ครอบคลุมพื้นที่ตำบลกุดกว้าง (นอกเขตเทศบาลตำบลหนองแก)

• เทศบาลตำบลยางคำ ครอบคลุมพื้นที่ตำบลยางคำทั้งตำบล

• เทศบาลตำบลโนนสะอาด ครอบคลุมพื้นที่ตำบลโนนสะอาด (นอกเขตเทศบาลตำบลหนองแก)

• เทศบาลตำบลบ้านผือ ครอบคลุมพื้นที่ตำบลบ้านผือทั้งตำบล

• องค์การบริหารส่วนตำบลหนองเรือ ครอบคลุมพื้นที่ตำบลหนองเรือ (นอกเขตเทศบาลตำบลหนองเรือ)

• องค์การบริหารส่วนตำบลบ้านเม็ง ครอบคลุมพื้นที่ตำบลบ้านเม็งทั้งตำบล

• องค์การบริหารส่วนตำบลบ้านกง ครอบคลุมพื้นที่ตำบลบ้านกง (นอกเขตเทศบาลตำบลดอนโมง)

• องค์การบริหารส่วนตำบลจระเข้ ครอบคลุมพื้นที่ตำบลจระเข้ (นอกเขตเทศบาลตำบลดอนโมง)

• องค์การบริหารส่วนตำบลโนนทัน ครอบคลุมพื้นที่ตำบลโนนทันทั้งตำบล